MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015850	CAGC	2	8	49805	49812	25 %	0 %	25 %	50 %	340780788
1002	NC_015850	GCA	2	6	49868	49873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780788
1003	NC_015850	GCTG	2	8	49902	49909	0 %	25 %	50 %	25 %	340780788
1004	NC_015850	CTG	2	6	49971	49976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780788
1005	NC_015850	GGT	2	6	50063	50068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780788
1006	NC_015850	GC	3	6	50091	50096	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
1007	NC_015850	GC	3	6	50165	50170	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
1008	NC_015850	ACA	2	6	50215	50220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780788
1009	NC_015850	CTG	2	6	50435	50440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780789
1010	NC_015850	GCT	2	6	50558	50563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780789
1011	NC_015850	GTG	2	6	50603	50608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780789
1012	NC_015850	GCACGC	2	12	50625	50636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340780789
1013	NC_015850	CGG	2	6	50647	50652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780789
1014	NC_015850	GGC	2	6	50686	50691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780789
1015	NC_015850	GTG	2	6	50792	50797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780789
1016	NC_015850	CGG	2	6	50872	50877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780789
1017	NC_015850	CATC	2	8	50945	50952	25 %	25 %	0 %	50 %	340780790
1018	NC_015850	GCTG	2	8	50969	50976	0 %	25 %	50 %	25 %	340780790
1019	NC_015850	TCC	2	6	50984	50989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780790
1020	NC_015850	GTCCTC	2	12	51001	51012	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340780790
1021	NC_015850	C	6	6	51026	51031	0 %	0 %	0 %	100 %	340780790
1022	NC_015850	GCA	2	6	51048	51053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780790
1023	NC_015850	CCTG	2	8	51108	51115	0 %	25 %	25 %	50 %	340780790
1024	NC_015850	CGC	2	6	51123	51128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780790
1025	NC_015850	TGC	2	6	51138	51143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780790
1026	NC_015850	TGG	2	6	51151	51156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780790
1027	NC_015850	CGC	2	6	51219	51224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780790
1028	NC_015850	A	6	6	51275	51280	100 %	0 %	0 %	0 %	340780790
1029	NC_015850	CT	3	6	51333	51338	0 %	50 %	0 %	50 %	340780790
1030	NC_015850	GGA	2	6	51393	51398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780790
1031	NC_015850	C	6	6	51440	51445	0 %	0 %	0 %	100 %	340780790
1032	NC_015850	CGC	2	6	51535	51540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780790
1033	NC_015850	TGG	2	6	51573	51578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780790
1034	NC_015850	GCG	2	6	51595	51600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780790
1035	NC_015850	CAG	2	6	51619	51624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780790
1036	NC_015850	TTTC	2	8	51768	51775	0 %	75 %	0 %	25 %	340780790
1037	NC_015850	T	6	6	51864	51869	0 %	100 %	0 %	0 %	340780790
1038	NC_015850	ACC	2	6	52057	52062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780790
1039	NC_015850	GCG	2	6	52174	52179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780790
1040	NC_015850	AGC	2	6	52181	52186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780790
1041	NC_015850	CGA	2	6	52255	52260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1042	NC_015850	GTG	2	6	52275	52280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780791
1043	NC_015850	CTC	2	6	52317	52322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780791
1044	NC_015850	TGT	2	6	52330	52335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780791
1045	NC_015850	CCTAC	2	10	52343	52352	20 %	20 %	0 %	60 %	340780791
1046	NC_015850	GCC	3	9	52442	52450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780791
1047	NC_015850	GCC	2	6	52500	52505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780791
1048	NC_015850	GCA	2	6	52529	52534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1049	NC_015850	CGA	2	6	52577	52582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1050	NC_015850	TGC	2	6	52591	52596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1051	NC_015850	GAG	2	6	52620	52625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780791
1052	NC_015850	CTG	2	6	52632	52637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1053	NC_015850	CGCTG	2	10	52643	52652	0 %	20 %	40 %	40 %	340780791
1054	NC_015850	GCG	2	6	52697	52702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780791
1055	NC_015850	CTGGC	2	10	52752	52761	0 %	20 %	40 %	40 %	340780791
1056	NC_015850	GTG	2	6	52809	52814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780791
1057	NC_015850	CGA	2	6	52820	52825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1058	NC_015850	GGCC	2	8	52834	52841	0 %	0 %	50 %	50 %	340780791
1059	NC_015850	GCCG	2	8	52862	52869	0 %	0 %	50 %	50 %	340780791
1060	NC_015850	GCC	2	6	52874	52879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780791
1061	NC_015850	GC	3	6	52947	52952	0 %	0 %	50 %	50 %	340780791
1062	NC_015850	CGC	3	9	52964	52972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780791
1063	NC_015850	C	6	6	52981	52986	0 %	0 %	0 %	100 %	340780791
1064	NC_015850	TTC	2	6	53005	53010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780791
1065	NC_015850	AGC	2	6	53105	53110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780791
1066	NC_015850	GC	3	6	53109	53114	0 %	0 %	50 %	50 %	340780791
1067	NC_015850	GA	3	6	53119	53124	50 %	0 %	50 %	0 %	340780791
1068	NC_015850	A	6	6	53124	53129	100 %	0 %	0 %	0 %	340780792
1069	NC_015850	CGG	2	6	53130	53135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780792
1070	NC_015850	TGC	2	6	53154	53159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1071	NC_015850	CGG	2	6	53185	53190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780792
1072	NC_015850	ATC	2	6	53213	53218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780792
1073	NC_015850	ATT	2	6	53316	53321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780792
1074	NC_015850	GC	3	6	53409	53414	0 %	0 %	50 %	50 %	340780792
1075	NC_015850	GCCT	2	8	53429	53436	0 %	25 %	25 %	50 %	340780792
1076	NC_015850	GGA	2	6	53458	53463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780792
1077	NC_015850	ATT	2	6	53580	53585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780792
1078	NC_015850	CTG	2	6	53663	53668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1079	NC_015850	CTG	2	6	53705	53710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1080	NC_015850	CCT	2	6	53731	53736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780792
1081	NC_015850	GC	3	6	53789	53794	0 %	0 %	50 %	50 %	340780792
1082	NC_015850	GAC	2	6	53807	53812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1083	NC_015850	TCC	2	6	53817	53822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780792
1084	NC_015850	T	7	7	53866	53872	0 %	100 %	0 %	0 %	340780792
1085	NC_015850	CAG	2	6	53897	53902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1086	NC_015850	G	6	6	53953	53958	0 %	0 %	100 %	0 %	340780792
1087	NC_015850	CCA	2	6	53963	53968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780792
1088	NC_015850	GCT	2	6	53974	53979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1089	NC_015850	TCG	2	6	54012	54017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1090	NC_015850	TTC	2	6	54033	54038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780792
1091	NC_015850	CGT	2	6	54070	54075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1092	NC_015850	GCG	2	6	54110	54115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780792
1093	NC_015850	TCG	2	6	54153	54158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1094	NC_015850	GAG	2	6	54176	54181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780792
1095	NC_015850	TGA	2	6	54270	54275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780792
1096	NC_015850	CGT	2	6	54355	54360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780792
1097	NC_015850	CGG	2	6	54423	54428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780792
1098	NC_015850	ATC	2	6	54431	54436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780792
1099	NC_015850	CGC	2	6	54454	54459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780792
1100	NC_015850	GAG	2	6	54494	54499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780792
1101	NC_015850	GAT	2	6	54669	54674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780793
1102	NC_015850	TCG	2	6	54703	54708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780793
1103	NC_015850	TGT	2	6	54719	54724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780793
1104	NC_015850	GCGT	2	8	54777	54784	0 %	25 %	50 %	25 %	340780793
1105	NC_015850	CTC	2	6	54856	54861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780793
1106	NC_015850	TTC	2	6	54988	54993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780793
1107	NC_015850	CATGGC	2	12	55023	55034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340780793
1108	NC_015850	GGT	2	6	55134	55139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780793
1109	NC_015850	GCG	2	6	55161	55166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780793
1110	NC_015850	TGG	2	6	55313	55318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780793
1111	NC_015850	TTCTGG	2	12	55354	55365	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340780793
1112	NC_015850	TGC	2	6	55383	55388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780793
1113	NC_015850	ATC	2	6	55390	55395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780793
1114	NC_015850	CAT	2	6	55530	55535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780793
1115	NC_015850	GAA	2	6	55552	55557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780793
1116	NC_015850	TGC	2	6	55580	55585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780793
1117	NC_015850	CCT	2	6	55665	55670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780793
1118	NC_015850	CAG	2	6	55689	55694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780793
1119	NC_015850	TGA	2	6	55748	55753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780793
1120	NC_015850	TCT	2	6	55755	55760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780793
1121	NC_015850	CTG	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780793
1122	NC_015850	GGGCC	2	10	55856	55865	0 %	0 %	60 %	40 %	340780793
1123	NC_015850	TATC	2	8	55927	55934	25 %	50 %	0 %	25 %	340780793
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1252	NC_015850	GGC	2	6	62341	62346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780800
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1256	NC_015850	GTG	2	6	62642	62647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780800
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1370	NC_015850	GCC	2	6	68077	68082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780805
1371	NC_015850	CAC	2	6	68284	68289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780805
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1373	NC_015850	CAGGCG	2	12	68323	68334	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340780805
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1499	NC_015850	CGGA	2	8	74113	74120	25 %	0 %	50 %	25 %	340780810
1500	NC_015850	CAG	2	6	74152	74157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780810

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